西湖教育基金会是西湖大学的举办者和捐赠资金的筹资主体。经浙江省民政厅批准，基金会于2015年成立，为非公募基金会。基金会理事会由施一公、陈十一、潘建伟、饶毅、钱颖一、张辉、陈越光、甘中学、赵伟、张磊、孙幼幼、刘旻昊、俞熙娜构成。俞熙娜担任基金会秘书长。